Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APOBEC4Q8WW27 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms