Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms