Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms