Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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