Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA5Q6Q788 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms