Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC174Q6PII3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms