Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
UFSP1Q6NVU6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UFSP1Q6NVU6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms