Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRNP1Q6NT89 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms