Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UPP1Q16831 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UPP1Q16831 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms