Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLPPQ16740 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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