Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GRIK4Q16099 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GRIK4Q16099 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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