Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C1orf61Q13536 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms