Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLAMF1Q13291 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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