Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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GTF3C1Q12789 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GTF3C1Q12789 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C1Q12789 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C1Q12789 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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