Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFFO1Q0D2I5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFFO1Q0D2I5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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