Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DSC2Q02487 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DSC2Q02487 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms