Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XPCQ01831 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XPCQ01831 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XPCQ01831 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XPCQ01831 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XPCQ01831 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms