Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1DQ01668 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms