Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK5Q00535 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms