Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA4Q00056 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms