Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HBBP68871 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HBBP68871 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HBBP68871 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms