Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SPCS3P61009 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPCS3P61009 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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