Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRPC1P48995 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms