Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CDKN1BP46527 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms