Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTGIRP43119 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTGIRP43119 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms