Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCC1P33527 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCC1P33527 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms