Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPS1P31327 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CPS1P31327 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPS1P31327 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPS1P31327 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPS1P31327 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms