Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTGS1P23219 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms