Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTA3P0C7M3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms