Protein–RNA interactions for Protein: P02746

C1QB, Complement C1q subcomponent subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QBP02746 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QBP02746 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QBP02746 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms