Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOA1P02647 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms