Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNKO75909 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCNKO75909 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms