Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC22O60826 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC22O60826 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms