Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXC11O43248 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXC11O43248 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms