Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBTB39O15060 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms