Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNPO3Q9Y5L0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNPO3Q9Y5L0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNPO3Q9Y5L0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNPO3Q9Y5L0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms