Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y572

RIPK3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK3Q9Y572 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RIPK3Q9Y572 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RIPK3Q9Y572 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIPK3Q9Y572 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIPK3Q9Y572 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms