Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
R3HCC1Q9Y3T6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
R3HCC1Q9Y3T6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
R3HCC1Q9Y3T6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms