Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1Q9Y3L3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SH3BP1Q9Y3L3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
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