Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y345

SLC6A5, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A5Q9Y345 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A5Q9Y345 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC6A5Q9Y345 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC6A5Q9Y345 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC6A5Q9Y345 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms