Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNIP3Q9Y2W7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCNIP3Q9Y2W7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCNIP3Q9Y2W7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNIP3Q9Y2W7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms