Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SBNO2Q9Y2G9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
SBNO2Q9Y2G9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SBNO2Q9Y2G9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SBNO2Q9Y2G9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms