Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSX2IPQ9Y2D8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SSX2IPQ9Y2D8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSX2IPQ9Y2D8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SSX2IPQ9Y2D8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms