Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEU3Q9UQ49 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEU3Q9UQ49 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEU3Q9UQ49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEU3Q9UQ49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEU3Q9UQ49 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms