Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHOC2Q9UQ13 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHOC2Q9UQ13 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHOC2Q9UQ13 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHOC2Q9UQ13 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
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