Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNM6

PSMD13, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD13Q9UNM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD13Q9UNM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSMD13Q9UNM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PSMD13Q9UNM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMD13Q9UNM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms