Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX12Q9UMY4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX12Q9UMY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX12Q9UMY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX12Q9UMY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX12Q9UMY4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX12Q9UMY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms