Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PNMA2Q9UL42 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNMA2Q9UL42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNMA2Q9UL42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PNMA2Q9UL42 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms