Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IKZF3Q9UKT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IKZF3Q9UKT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IKZF3Q9UKT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IKZF3Q9UKT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms