Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF3C4Q9UKN8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF3C4Q9UKN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms